Die nach DIN EN ISO 9001:2008 zertifizierte Handwerkskammer Südwestfalen ist in drei Geschäftsbereiche aufgeteilt: 

• GB I: Verwaltung, Haushalt und Finanzen
  Leitung: Hauptgeschäftsführer Ass. jur. Meinolf Niemand
• GB II: Justitiariat und Berufsbildung
  Leitung: N. N.
• GB III: Berufsbildungszentrum und Wirtschaftsförderung
  Leitung: Geschäftsführer Dipl.-Kfm. Christoph Dolle

Außerdem gibt es zwei Stabsstellen, die direkt dem Hauptgeschäftsführer unterstellt sind: Presse- und Öffentlichkeitsarbeit und Qualitätsmanagement. Hierzu kommt, angesiedelt am GB III, der Bereich Projekte.